過濾器是生物**柜的關鍵組成部分，主要起到過濾**和灰塵顆粒的作用，以凈化吹入**柜工作區和排放出的氣體。**柜里所使用的過濾器一定要有足夠的過濾效率，否則就起不到防護生物危害的作用。過濾器材料應采用硅酸鹽玻璃纖維，目前**柜中通常采用的是對 0.3μm 的塵埃微粒截流效率為 99.99% 的 HEPA 高效過濾器，而采用全新技術的微褶皺無間隔 ULPA 超高效過濾器對 0.12μm 的塵埃微粒擁有 99.999% 的截流效率，并擁有更緊密的結構和更大的過濾面積，可在工作區域內提供相當于 ISO 標準中 3 級的潔凈度。 針對現場完整性檢測及**柜年度認證檢測要求，空氣濾器必需在現場條件下，無需額外的工具就能進行濾器完整性測試，而且無需接近污染區域。在工作區域內必需裝有一個逆流的取樣孔，以便在現場條件下進行濾器的完整性檢測。
一臺符合**柜國標標準的風機系統，首先應具有風量自動補償功能，可以在過濾器負載風壓下降至一定范圍內，實現自動補償風量以維持氣流流速恒定；其次，電機擁有熱保護功能，可以在 1.15 倍額定電壓值條件下穩定工作。
目前生物**柜中采用的是更為先進的免維護離心式外轉子風機系統，與已經被潔凈行業廣泛認可的離心式外傳子風機和普通風機相比，無需添加潤滑油，另外擁有結構緊密、重量輕、平衡好、散熱好和 100% 速度控制的特色，并擁有良好的穩定性和更長的使用壽命。
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